影之刃3的支线任务系统设计精巧，不同选择将直接影响任务奖励和剧情走向。支线任务通常包含多个对话选项和分支路径，其中部分选项会导向最高奖励流程。例如童心难存任务需在落鸦村落鸦废墟找到妞妞后选择善意隐瞒，随后跟随指引找到妞妞父亲并给予1000铜币，这是该任务的最高奖励流程。类似设计贯穿多数支线，玩家需谨慎选择以获得最优回报。
部分支线任务存在隐藏机制，需要特定操作才能触发完整流程。冤有头债有主任务中，玩家需将获得的筹码交给豪客而非赌坊老板，才能得到贪婪华服装备。若选择交给老板则只能获得1500元宝，且任务仅能完成一次。类似的关键选择还出现在同道中人任务中，第一次需不听老乞丐劝告，第二次则要听从建议，这种特定顺序才能确保获得元宝奖励。
任务兼听展示了典型的道德困境设计，玩家需在落日隘口找到董文获取锦盒，将其交给坠星丘陵的董武后，董武会因盒中机关中毒。返回询问董文得知下毒原因是弟弟杀害嫂子，而董武则声称是哥哥骗婚。最终玩家需要先后击杀兄弟二人才能完成任务，这种非黑即白的剧情设计体现了游戏叙事的复杂性。
侠义长歌任务的最佳流程要求在追凶路找到谢彤川触发任务，获取断剑后送至红叶寺住持内院给杨家大嫂，对话时选择特定选项，最后告知谢彤川方法错了。若选择是你错了则奖励减少为100元宝和70残页，而正确选择可获得110元宝和84残页。类似机制在入戏任务中也有体现，正确归还香囊才能获得完整奖励。
部分支线任务需要玩家在特定地点触发，如正义使者需在黄昏道幽怨径听人闲聊开启，随后在多个地图继续听取对话，最终找到目标人物击杀。这类任务的触发条件较为隐蔽，需要玩家仔细探索地图每个角落。任务天外飞仙则要求在白山路找到受伤的奇怪打扮者，跟随剧情调查并摧毁装置，过程中任何错误选择都可能导致任务失败。
游戏中的支线任务奖励主要包括经验值、元宝和残页三类资源，最高奖励流程往往能提供额外装备或心法。如医者私心任务选择帮凶之举可获得谢回春配戒和仙风道骨蓝图，奇戒双生任务正确完成能获得蛇眼遗物和押镖之链医者传承。这些奖励对角色培养至关重要，建议玩家在关键选择前存档或查阅攻略以确保最优结果。
