摧毁舰船是无尽的拉格朗日中核心战斗机制之一，涉及武器选择、战术编队和系统破坏等多维度策略。舰船分为护卫艇、驱逐舰、巡洋舰等类型，不同舰船需针对性使用重炮、鱼雷或能量武器进行打击。能量武器如斗牛级、刺水母级能无视护甲造成真实伤害，对装甲型战舰尤为有效；常规火炮和鱼雷则需优先攻击敌方舰船的薄弱模块，如动力系统或武器舱。
战斗序列和站位安排直接影响摧毁效率。防御型舰船应置于前排吸收伤害，中后排配置高输出舰船如红宝石级或艾奥级巡洋舰。根据敌方舰船类型调整编队：若敌方以战机为主，需增加防空型舰艇；对抗大型战舰时，集中火力攻击其主系统可触发绝育效果，使目标丧失战斗能力。舰载机的运用也需注意，无人机可提供持续干扰但无法被摧毁，合理利用能压制敌方修复能力。
拆解无用舰船是资源管理的重要环节。通过指挥部界面进入舰船详情页，点击拆除按钮可获取模组和设计图资源，稀有度越高回报越丰厚。需注意拆除前需撤下指挥官和舰员，避免连带损失。橙色以上紫卡舰船除非重复否则不建议拆解，其战略价值远高于拆解所得。拆解功能更适合处理低级冗余舰船，为舰队腾出指挥值空间。
地形和战术策略能弥补舰船质量差距。利用小行星稀疏区限制巡洋舰以上舰船移动，或引导敌方进入辐射区削弱其小型舰艇优势。战斗中需实时监控防护盾状态和武器冷却时间，把握集火时机。偷袭基地时曲率速度是关键，通过已探明曲率的路径可实现快速打击。PVP中需保持舰队机动性，避免陷入消耗战。
舰船技术值加点优先提升火力与生存能力。阋神星级驱逐舰建议优先点出火炮集火和弹药强化；动力系统侧重机动规避等闪避技能。不同舰船的子型号差异显著，如星云追逐者脉冲炮型虽基础型号平庸，但改造后强度堪比顶级舰船。技术值分配需结合舰船定位，前排优先护甲，后排强化输出，形成完整攻防体系。
